解:根據題干分析可得:
平行四邊形AFCH的面積+平行四邊形BGDE的面積=正方形ABCD的面積,
則兩個平行四邊形的面積和-陰影部分的面積+4×△AEP的面積=正方形ABCD的面積,
所以陰影部分的面積=4×三角形AEP的面積,
=4×12,
=48(平方厘米),
答:陰影部分的面積是48平方厘米.
分析:

正方形中E、F、G、H分別是中點,在圖形中,根據圖形的平移和旋轉的性質,可得出:△AEP、△BFM、△CGN、△DHO是形狀、大小都相同的四個三角形;
E、G分別是中點,可得:BE=DG,所以四邊形BGDE是平行四邊形,
同理,四邊形AFCH也是平行四邊形,
平行四邊形AFCH的面積+平行四邊形BGDE的面積=正方形ABCD的面積,
其中上式等式左邊陰影部分的面積重合了一次,
則兩個平行四邊形的面積和-陰影部分的面積+4×△AEP的面積=正方形ABCD的面積,
所以陰影部分的面積=4×三角形AEP的面積=4×12=48(平方厘米),
點評:此題應用了平行四邊形的定義以及平移與旋轉的性質,將陰影部分的面積轉化到平行四邊形和三角形的面積中進行求解.